孙文被抓之后，整个中国乃至世界都分成了两种声音，一派喊打，一派要求释放，喊打的一派主力就是当年光复会的老人，还有北洋的一些将领，以及海外华人组织，他们认为孙文一系祸国殃民，分裂国家，挑起战火，理应受到惩罚。
而强烈要求释放孙文的势力就比较多了，整个学界都在为孙文奔走呼号，各地甚至掀起游行示威的浪潮，而且像曰美等过也先后发表声明，表示极为关注，特别是曰本，强烈要求西南释放孙文，尤其是这次不只抓捕了孙文，还有大批的民党骨干，其中有些人还有曰本身份，曰本就以此为借口，大加干涉。
不过乔宇并没有被这些杂音干扰，而是采取果断的方针，尽可能的将孙文一系一网打净，陆荣廷已经广东的军阀陈炯明此时也卖力的行动起来，陈炯明曾经是广东都督，当初钦州一战，龙济光被捕，粤军群龙无首，陆荣廷趁机拿下了两广，不过不少粤军将领重新拥戴陈炯明作为粤军的统帅，作为抗衡陆荣廷的领袖。
孙文到了广州之后，陈炯明顾念香火情分，加上也确实想要利用孙文的名望抗衡陆荣廷因此很支持孙文，但是两个人在政治理念之上有着严重的分歧，比如这次孙文组建非常国会，选举什么大元帅，都让陈炯明十分反感，孙文甚至准备联络各方势力进行北伐，更让主张联省自治，和平协商的陈炯明坚决反对。
如今西南军从天而降将孙文抓捕，使得陈炯明猛然惊觉想要对付陆荣廷，完全可以借助西南的势力，现在对孙文党羽下手越狠，就越能够取悦乔宇，因此陈炯明也大肆逮捕孙文党羽。
有了陆荣廷和陈炯明两个地头蛇的努力，孙文党徒之中大半被捕，只有少部分逃到了香港，还有一些逃到了曰本，但是骨干尽没，这些虾兵蟹将也没有什么作用了。
就在全国都关注乔宇究竟要怎么对付孙文的时候，突然西南的报纸，广播开始大量的披露当年陶成章一案的内幕情况，称当年的杀手已经抓住，就是孙文最信任的心腹蒋志清，他两次暗杀陶成章，第一次被挫败，第二次则是使用烈姓炸药，陶成章惨死，随着陶案披露，宋教仁案又一次被提了出来。
现在距离这两个案子的时间也就三五年而已，当事人俱在，很多证据虽然被毁掉了，但是还是有很多的蛛丝马迹存在，另外让人瞩目的就是黄远庸一案，三大暗杀同时被翻了出来。
除此之外在逮捕孙文的时候，还缴获了大量的往来文件，其中就包括和曰本的文件，这些东西都是杀伤力十分惊人的，随着大量的披露，呈现在中国百姓面前一个全新的孙文，杀人犯，卖国贼！
西南最高检察院已经开始立案侦查孙文叛国案，蒋志清等人也陆续被审讯，就在深入调查的时候，乔宇终于发表了自己对孙文一案的看法，在谈话之中乔宇指出逮捕孙文并非政治斗争原因，而是孙文涉嫌暗杀，卖国等罪名，如果任由一个犯罪分子再这么招摇撞骗，一定会威胁到国家的安全，因此处于对国家和民族负责的精神，才会将孙文逮捕。
处理孙文一定会按照法律途径，进行审讯，任何关注孙文案子的人都可以旁听，为孙文辩护，由于涉案人员众多，时间跨度很大，需要进行详细的侦查，才能够提起公诉。
乔宇的谈话也很快传遍全国，虽然大家都不相信乔宇所说不涉及政治原因，这就是欺人之语，但是大家还是比较在意乔宇说的审判问题，只要能够诉诸法律，就能有一线生机，因此全国法学界的名人几乎都行动起来，甚至还聘请了数位曰本法律顾问，组成了强大的律师团，准备为孙文辩护。
其实自从抓住了孙文之后，乔宇就不太在乎种种非议，等待孙文的只能是在监狱之中渡过余生，乔宇可不同于别的军阀政客，既然决定的事情，就不会改变，可以说法律不过是一个过场而已。
更让乔宇关心的是陈炯明发来的电报，在电报之中陈炯明血泪千行，控诉陆荣廷在广东的暴行，要求乔宇能够出面惩治陆荣廷，换广东一个清明世界，朗朗乾坤。
“参谋长，你看这陈炯明还是比较上道的，陆荣廷在孙文的问题上还算配合，我正不知道用什么借口进入两广呢，他就给我送来了这么一封电报，把电报的内容公布出去，然后我们就以调解两广矛盾的借口出兵两广，西南必须要有一个合适的出海口了！”
在乔宇原本的计划之中，并没有想要过快的发展，关键还是要夯实基础，但是一战带来的好处远远超出想象，坐拥天下第一强军，乔宇也不愿意在看到中国陷入无穷的内战之中，而且抛开后世的观念束缚，其实现在孙文一系还不是很强大，就是一帮乌合之众而已，拿下他们甚至不用大动干戈，那何乐而不为呢。