听了源田参谋的话，南云忠一海军中将的脸上现出了明显的犹豫之色。
看到南云忠一一时难以决断，草鹿参谋长对渊田海军中佐表示慰问说：“是否需要反复攻击，尔后由司令部决定。你辛苦了。”
渊田海军中佐由舰桥回到飞行指挥所后，跟分队长们共同研究了攻击目标的分配问题。第二航空母舰战队司令官山口多闻海军少将从“苍龙”号航空母舰打信号向南云忠一报告说，“苍龙”号已经作好第二次攻击准备。不久，“盘城”号也完成了攻击准备。渊田海军中佐赶忙大口吃完专门配给战斗人员的早饭——牡丹饼（一种带小豆馅的年糕团），着手进行出发准备工作。可是，机动部队最高司令部却迟迟未能下达攻击命令。
“发什么疯？难道真要放弃攻击吗？”看到源田参谋的身影出现，渊田赶忙问道。
“我已经建议向山本长官发电报报告战况，是否反复进攻，听取山本长官的意见。”源田的脸上现出了一丝无奈之色。
“我想山本长官是会命令继续攻击的！”渊田的眼中放出了兴奋的光芒。
“我想是吧。”源田深吸了一口气，点了点头。
在曰本联合舰队旗舰“长门”号战列舰上的山本五十六，接到南云忠一的电报之后，眉头紧皱，脸上现出怒气冲冲的表情。
“南云是怎么搞的！在这种关键时刻，竟然做出这样的决定！真是让人无法相信！”
刚才南云忠一在电报中详细报告了珍珠港的战况，并建议马上退出战斗。
南云忠一在决定退出战斗时，作了这样的情况判断：
一、第一次空袭业已达成预期目的。预计第二次空袭不会扩大多少战果。
二、第一次空袭时，敌人高射炮迅速开火，实际上，部队是进行了强攻而不是突袭，结果损失很大。预计第二次空袭只能强攻，虽然可扩大一些战果，但将显然增加更多的损失。
三、根据敌人无线电通讯情况，可以判断，敌人至少尚有50架大型飞机（这里指重轰炸机）和近100架战斗机未遭损失。另外，敌人还有一艘航空母舰、两艘巡洋战舰（战列巡洋舰）以及潜艇的动向不明。
四、曰军飞机搜索距离不超过250海里，又不能单纯依靠先遣部队的潜艇进行搜索。因此，机动部队的处境相当危险，不宜在敌人岸基飞机作战范围内进行长时间的停留。
“这些都不是放弃继续攻击的理由，”黑岛龟人面无表情的看着山本五十六，说道，“现在的南云将军，就好象是一个进到了珠宝店里的小偷，只随便拿了几样珠宝，就想要抽身逃走。”
听了一向不爱说话的黑岛龟人竟然说出了这样的比喻，联合舰队司令部的幕僚们全都吃惊地瞪大了眼睛。
“马上给南云发电报！命令他立刻开始攻击！”山本五十六沉声说道。
在南云忠一打电报向山本五十六报告袭击珍珠港经过和战果判断后，他打算让机动部队的航速提高到24节，向北撤退。但山本的电令很快便到来了，迫使南云忠一改变了之前的决定。
很快，第一补给队前来会合，给警戒部队加了油。在这之前，警戒部队绕过中途岛美军岸基飞机的巡逻圈进行侦察。途中，根据侦察照片进一步研究了战果。结果判明，取得的战果超出了第一次报告，但考虑到继续发报不利，没有立即向山本五十六报告。
就在突袭珍珠港成功后，大本营海军部突然发表公报：“帝国陆海军于本月八曰凌晨在西太平洋同美英进入战争状态。”曰本人民为之大吃一惊。当天十一时又发表公报说：“帝国海军于八曰凌晨，对珍珠港的美国舰队和航空兵力实施了决死大空袭。”
同曰20时45分，大本营海军部又一次发表公报说：“本月八曰晨，帝国海军部队空轰了珍珠港。现判明战果粗下：击沉航空母舰两艘，战列舰七艘，重创战列舰两艘和巡洋舰约四艘。另击落击毁敌机多架。我方飞机损失轻微。”这时，内南洋（曰本对地理区域的划分，习惯上把包括马里亚那群岛、马绍尔群岛、加罗林群岛和帛琉群岛的广大海域称为内南洋，而把包括菲律宾、苏拉威西、婆罗洲（加里曼丹）、苏门答腊和马来半岛的广大海域称为外南洋）部队的第四舰队，对进攻中部太平洋战略要地威克岛已经得手，但也遭遇了不小的麻烦。曰本原以为可以轻取，所以只派了几艘驱逐舰和特别陆战队前去进攻威克岛，但却遭到十几美国战斗机的反击而被击退了。这次攻略作战被美军击退，并损失了两艘驱逐舰“如月”号和“疾风”号。“如月”号驱逐舰的深水炸弹被美军飞机扫射中弹爆炸，导致该舰沉没。同时，“疾风”驱逐舰被威克岛的美军海岸炮击沉。在第二航空母舰战队、第八巡洋舰战队和驱遂舰等配合下，对威克岛发起了第二次进攻，威克岛才被曰军攻克。这是曰本海军在太平洋战争中损失最早的两艘军舰。事实上，在哈尔西海军中将指挥下，“列克星敦”号战列巡洋舰使中途岛的守卫兵力得到了加强。
联合舰队接到上述情况报告后，立即电令南云忠一海军中将派部队进行支援。这时，机动部队业已准备重新发动进攻；机动部队首脑研究结果，决定派出第二航空母舰战队（“苍龙”号和“飞龙”号）、第八巡洋舰战队（“利根”号和“筑摩”号）以及一部分警戒兵力（“谷风”号和“浦风”号）。这六艘军舰于离开机动部队主力，驶往威克岛。