不过话又说回来，新式学堂还尚处在起步阶段，所教的知识又多与生活脱节，不少学生毕业后找不到差事，百姓们没有感受到教育变革带来的好处，反而先受其害。因而对‘新学堂’抵触情绪比较浓烈，江西、江苏、浙江、广东等省份还出现了捣毁学堂、殴打教员的毁学事件。广东大浦湖山初等小学堂将当地的一座庙改建而成，引起了当地乡绅的强烈不满，遂制造事端伺机破坏。正巧当地多日未下雨，当地乡绅遂将天旱归咎于学堂，散布谣言说是学堂即教堂，民众受其蛊惑，将学堂焚毁一空。
因此，在这样的背景下，新学堂的发展还是举步唯艰的。
是年，正逢学堂第四批招录生员。叶昆以优异的成绩顺利通过了考试，开始了三年的新学生活。
在长安中学的这段时间，虽时局混乱，对新学的抨击指责不绝于耳。叶昆也从不受外界所干饶，学习刻苦，各科成绩优秀。他还是亦如往常一样，爱去孔庙练字，喜爱诗词，古代历史。也亦如往常一样沉默寡言。以致于同学们都亲切的称他为‘才子’。每每听到别人这样叫他，他只是低头笑笑，也不言语。
在长安中学的日子是平淡的，但也是他一生中最快乐的。对于旧时‘两耳不闻窗外事，一心只读圣贤书’的读书人而言，‘新学堂’开设的几何、化学、生物、地理等课程新鲜有趣，学生在上几何课时将辫子也派上了用场，可当作圆规在黑板上画圆；体育和音乐课在当时最受欢迎。教员或学生将学会的西洋曲调填上中文歌词，《男儿第一志气高》、《黄河》、《拉纤行》等学堂乐歌广为传唱。学堂还开设了修身、国文、地理、政治等富有现代特色的课程。还组织学生进行足球、网球、棒球、田径、游泳等体育活动，学堂借鉴欧美，将低年级的学生编为童子军，组织体育锻炼，高年级的学生组成陆军团，完全采用军事化的管理。
同时新式学堂的教员也往往来自留学生，他们教学往往不计报酬甚至自掏腰包。传授新的自由、平等、革命等思想，传播新知识团体所刊印的新书、报刊。是革命和立宪思想最为活跃的传播者。叶昆的革命思想也从这里开始启蒙。
除了春节以外，叶昆虽然很少回家。但几乎每天都会给家里写一封家书。一来，他就是那么爱写字；二来，寄托对父母的思念。父亲也经常回信勉励他，只是在叶鸿恩的信中隐隐约约也透露出他的一些想法，他其实并不看好叶昆念的这个‘长安中学’，还是希望他尽早回到父母身边。
不过三年之后，叶昆却以优异的成绩考取了北京大学历史系。开始了他人生中崭新的一页。
谁能说这不是命运注定的安排呢？都说命运捉弄人，可这命运若是想要安排你，却是你躲都躲不掉的！
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