之所以确定会议的地点是加拿大而不是美国，是威尔逊总统的建议。鉴于美国大选的临近以及国内激烈的反战情绪，威尔逊总统建议将会议放在属于英联邦的加拿大召开，如果一切顺利，对于中国方面提出的援助问题可以回到美国细谈，他将组织一个专门的委员会进行讨论，最后报国会批准。
威尔逊的建议是，因为美中两国良好的外交关系，说服国会对中国进行工业建设方面的援助或贷款不是很大的问题，但不要将此事与中国参战扯在一起。目前美国政府上层基本倾向于加入协约一方，但近一千万德裔是支持德国的，这股势力不小。而且，普通民众中反对参战的呼声仍是主流。而他连任竞选的口号就是力争早日恢复世界和平，为了顺利实现连任，目前不能刺激美国民众的情绪。
会议的主题是讨论中国参战，其中又包含两三问题，第一是中国加入协约国后的地位问题，涉及关税自主、庚子尾款及治外法权等有关中国主权归还的讨论。第二是中国参战的问题，涉及兵力、战场选择、指挥体系、后勤供应等一系列问题；其三是对中国的援助问题，主要是跟美国谈。
在会议的第一阶段就基本解决了中国主权的归还的一揽子问题了，俄国在获知中国将直接出兵俄国战线后，立即同意了他们最在意的赔款尾款问题。在辛丑条约所确定的3亿两白银的赔款中，俄国占比最高，虽然中国已经赔付了约三分之一（含利息），但余款对于财政极为拮据的俄国还是一笔不菲的收入。
关税自主是更重要的问题，英法俄希望中国在获得关税自主权后将关税确定在不超过10%的水平，现在的关税统统定在5%的低位，这已经翻了一番了。方声远答应了英法俄的要求，其实，更在意关税水平的不是英法俄而是美国。但美国的态度很积极，这个问题也得到了圆满的解决。
给中国巨大伤害的治外法权也无可奈何地取消了，美英法俄四国承诺，在中国加入协约国参战后，中国将享受外交上的平等待遇。
租界问题暂时搁置。
方声远在确定了外交方面必须坚持的原则后任务即将会谈的主要任务交给了司徒均，后者将与参加会议的英法俄三国代表团的军事专家进一步讨论中方参战后的军事问题，涉及的方面很广，但主要是牵涉俄国。方声远的精力转到了与美国人为主的经济援助方面。方声远带来的方案胃口很大，要求协约国及美国展开对华经济援助——它是中国参战的必要前提。这方面将主要由美国承担。
在司徒均与俄国方面基本达成有关军事协议的同时，经济援助的一揽子方案也基本确定了。美国及英国承诺在三年内向中国提供高达5.3亿美元的低息和无息贷款用于加强中国的军事工业建设，其中英国承担0.8亿美元的份额。贷款将用于购买美英两国的技术及设备——涉及130个工厂的新建和改建，涉及炼钢、造船、发电、采矿、化工、机械、电子诸多行业，引进的各类机床高达9000余台。
这些项目的落地将使得中国第一个五年计划中的工业建设目标超额完成，项目建成后，中国的工业化将奠定基础，军工能力能得到大幅加强。就炼钢能力将突破400万吨大关，发电能力提高1.5倍，填补了一批中国工业的空白。
龙谦在对两院议员汇报“波士顿”协议时针对贷款问题解释说，迄今为止的历史上，尚无一个国家的工业化进程不需要引入外部资金，即便是最早实现工业革命的英国，也得到了来自荷兰的大笔资金。无息贷款已经非常难得了，如果不是抓住了世界局势的机遇，即便是已经确定中国为全球盟友的美国也不会答应如此优厚的条件。
美国为了培养自己在远东的盟友，大力促成了这个协定的签署。在威尔逊领导的美国政府看来，加强中国的工业实力符合美国的利益。损失的利息将从企业的利润中得到补偿，高达4.5亿的订单将落在美国人头上。而英法俄最为担心的领土交涉中国并未提及，这是协约国主要国家最为满意的。
协定是在波士顿签订的，史称“波士顿协定”。不过，当时并未使用这个名字，这是美国人要求的。
因为协定中关于工业援助的内容超过了自己的预期，方声远代表中国政府于1916年5月10日正式签署。协定的正文是中国加入协约国的有关条款，规定了中国的权利和义务。有关军事及经济的条款是以附件（秘密协定）的形式签署的，这符合外交的惯例。
中方在获得协议签订的消息后，龙谦接见了焦急等待的阿尔杰米耶夫将军，向他通报了中国远征军组建的详细情况，承诺在7月5日前，第一集团军的前锋部队将正式出动。远征军将根据波士顿协定中有关军事问题的秘密协定加入俄国西南战线，接受俄军总司令部及西南方面军指挥。总参谋部将派出一个联络组与俄方具体商定部队的投送和后勤供应问题，并且承诺在秋季之后开始转交俄国总量达120万吨的谷物，这部分粮食的费用将由俄国承担一半。
阿尔杰米耶夫将军在6月14日离开了北京返回彼得堡，与他同行的是由新任副总参谋长范德平中将带领的有23名精选军官组成的联络组。