除了肇庆方向在韶关战役进行期间发生危机以外，闽北、闽西北、闽西三个方向明军也在武定元年的最初几个月内遭受到了清军的疯狂进攻。
其中因为建宁之变而被迫退守延平府城的福建总兵洪拱柱所部在面对绝对优势的清军不得不弃守坚城，利用闽江谷道且战且退，最终缓步退至黄田、桔林、水口、雄江一线固守。清军因为战地无法补充粮秣，后方转运困难的拖累，无力继续进攻，洪拱柱这才勉强得以保得古田、闽清两县及福州西翼的安全。
此时鉴于闽西北战局的变化以及粤北郑军为桑额部所牵制，自觉侧翼没有了威胁的江西巡抚兼领江西提督于成龙便再无一丝顾忌，遂指挥江西绿营自宁都、瑞金一线重新攻入闽西。大明福建左副总兵王新化率所部万人在汀州府城死守，但外无援兵内无粮草积蓄，只是凭着反叛者的恐惧硬撑着，形势可谓岌岌可危。
至于闽北方向，郑军左右勇卫师虽然沿海边山路层层阻击，但两师不过万余人根本不足以应付七八倍的敌军，清军用血肉开道在付出近万五的伤亡后，最终攻至白水冈、白沙、长岐尾一线，距离罗源县城也就一步之遥了。
整个福建战事全面对明军不利，只有被洪拱柱派往邵武的周正和部却一枝独秀，不但守住了邵武府城，更分兵控制了将乐、顺昌、建宁、泰宁诸县，不过周正和只是借着清军无暇顾及的空暇才得以猴子称大王的，其即无力反攻延平、建宁两府府城，也没有勇气壮士断腕的弃守邵武反攻入江西，最多只是苟延残喘而已。
“各地的战报，想必诸卿已经都通了，四面楚歌，看起来情况已经十分危急了。”福州城中，郑克臧不动声色的扫了扫面前的一众文臣武将。“但是孤却以为还有翻盘的机会。”在郑克臧的示意下，一副地图被摆了出来。“林卿，来为大家解一番。”
林升走到地图前，伸手一指：“参谋厅早在攻入广州之时便拟了两个方略以应对清虏可能的反击，其一是以左虎卫等五个师的兵力在福宁以北的桐山登陆，一举切断来犯清军的粮道，将其困死饿死在闽北。”
林升顿了顿：“这个方略的优点是利用本藩水师控制海权的便利，在清虏最薄弱的地方下刀，但缺点是一旦桐山易手，清军势必疯狂反扑，到时候闽浙两路夹击，对左虎卫等师而言势必是有一场血战，而且即便歼灭了闽北的清军，也不过是改变了一路战况，对全局并无太多补益，更不要在苏州的鞑酋会立刻派来更多的增援。”
完这段话，林升看了看面前诸人的反应，随即用手一比，还未话，场下看清楚的几个已经一阵抽气的声音，更有人不顾会被殿御使弹劾失仪的危险叫嚷了出声：“应天府！”
“没错，参谋厅的另一个方略就是直捣南京。”林升承认着，顿时场面的声浪一下子放大了，不过好在郑克臧随后一瞪眼，这才迫得全场肃静下来。“应天府是太祖皇帝龙兴之所。”林升继续道。“一旦克复南京，不但可以截断建虏南北之间交通，据江南米粮为我藩所用，更可以大张我朝声势，若能顺便将鞑酋康熙围在苏南，那还能一箭双雕。为此，参谋厅准动用如今在东宁的全部九个师及海龙骧师各团??????”
林升的话完了，殿内却鸦雀无声似乎之前的喧闹只是郑克臧的一种错觉而已，直到好半天后才由郑克臧本人打破了这种肃杀的气氛：“怎么都不话了，难不成对于参谋厅的两种方略，诸卿都没有意见吗？这可不成，本藩力量有限怕是不能纲目并举了。”
郑克臧的冷笑话并没有引起众人的笑声，反而又过了一会，元辅洪磊起身拱手道：“主上，臣观主上进取金陵的方略似乎与当年先王进取应天府的方略如出一辙，可是当年??????”
“洪阁老，此事不可同日而语。”郑克臧淡淡的回应道。“当年祖父大人是犯了轻敌之错，而今日孤却是准备以快打慢，抢在清虏反应过来之前动手，断不会给清虏以固守的机会。”到这，郑克臧补充道。“职方司费尽千辛万苦打探到清虏的虚实，应天万人、镇江六千、杭州一万，苏州因为鞑酋康熙亲在所以有二万人，如此兵力本藩足以逐个击破。”
“主上，虽然鞑酋康熙把身边的禁旅八旗分遣回北地消夏，但是轮戍的大军指日就到，一旦本藩顿兵于金陵坚城之下，后果不堪设想。”洪磊坚持着自己观点。“臣以为攻打桐山虽然只能暂缓一时的危噩，但总比把全部军力至于险境要好。”
“洪阁老此言大谬。”边上的林贤看到郑克臧的表情不悦，立刻站出来驳斥着洪磊。“以下官浅见，只要本藩的水师尚在，哪怕将陆师打光了，清虏也绝无跨海之虞。既然如此，为何不奋力一搏，如此即便不能一举扭转乾坤，也势必打乱了清军的步骤。”
“是何人？”洪磊瞪了林贤一眼。“一介降将而已，居心叵测还是轻的，还敢在此大放厥词。”林贤自是不敢跟这位老臣顶嘴，只好默默忍受着洪磊的羞辱，但洪磊似乎还不罢休，骂完林贤之后，转身向郑克臧进言道。“臣请诛这个奸佞。”
“洪阁老，够了。”郑克臧脸色阴沉至极。“此方略与林卿无涉，所以大可不必责难之。”郑军中的降将、降军委实不少，要按洪磊的意思，郑军不战就要垮了，因此郑克臧什么都不会采纳洪磊的建议的。“还是就事论事吧。”言罢，郑克臧命洪磊坐下，随即向另一边的柯平等人望去。“柯卿这边有什么主张吗？”