传染性支气管炎病毒（IBV）引起鸡传染性支气管炎。
猪冠状病毒（猪传染性胃肠炎冠状病毒，TGEV）。
牛冠状病毒（BCV）引起幼犊牛严重多发性肠炎。
猫冠状病毒（FCoV）引起猫的轻度肠炎和猫的严重感染性腹膜炎。
两种犬冠状病毒（一种引起肠炎，另一种见于呼吸道疾病）。
火鸡冠状病毒（TCV）引起火鸡肠炎。
雪貂肠道冠状病毒引起雪貂流行性卡他性肠炎。
雪貂全身冠状病毒引起雪貂类FIP综合征
泛热带犬冠状病毒。
猪流行性腹泻病毒（PED或PEDV）引起很高的仔猪死亡。
冠状病毒的进化
扒扒新型冠状病毒的祖宗十八代，揭秘其真实的来源和去处
冠状病毒最新共同祖先被认为在公元前8000年左右。蝙蝠和鸟类是温血飞行脊椎动物，是冠状病毒基因源的理想宿主，蝙蝠是α冠状病毒和β冠状病毒的基因源，鸟类是伽马冠状病毒和三角冠状病毒的基因源，为冠状病毒的进化和传播提供动力。
牛冠状病毒和犬呼吸道冠状病毒于1951年从同一祖先中分离出来。牛冠状病毒和人冠状病毒OC43于1899年分离。牛冠状病毒在18世纪末从马冠状病毒中分离出来。
人类冠状病毒OC43的MRCA可追溯到20世纪50年代。
中东呼吸综合征冠状病毒虽然与几种蝙蝠有亲缘关系，但在几个世纪前就从这些病毒中分化出来。
最密切相关的蝙蝠冠状病毒和SARS冠状病毒于1986年分离。
羊驼冠状病毒和人冠状病毒229E在1960年以前发生了变异。
人类冠状病毒NL63和蝙蝠冠状病毒在563到822年前共享一个MRCA。