当天的晚宴上，刘大同也代表秦铠宣布了另外一个决定，除了新成立的东北集团军外，从前线调回的新一、二、三、六、七、九、十各镇立刻进行整编，城里陆军部委员会统一协调军制整编事宜，各镇必须在两个月内完成新军编组并且足额补充队伍。
这倒命令不过三四十个字，但这绝对是让人震撼的消息……南洋新军从入京作战以来，一年多时间几乎都是整戈待旦，这新军制早就在军政部内部提过多次，却一直因为战事繁忙而无从下手，要知道，无论是扩编还是整编，那都意味着整支部队的指挥体系的崩溃，这对于队伍而言，无疑是致命的！
但是，南洋新军的整编却是如在弦之箭，不得不发……对滨海、阿穆尔行省的攻略中，以镇为指挥机构、以营为集团主杆的战争指挥模式已经曝露出太多的不便，以至于薛超、章奎、刘永福等不得不在战事中抽调jing干参谋到前线协调各营机动。 ..
更重要的是，以营为基础的军队，已经曝露出组织起大规模的战役上的指挥弊端，小口径野炮、骑炮、后装步枪、各类机关炮的出现，使得营级单位的战斗力大大增强，这次对双城子、海参威的进攻中，以营为单位的进攻模式，展示了南洋新军的突出战力。
但是，秦铠和参谋部、以及各镇的高层指挥官都意识到一个问题。南洋新军各镇。几乎都是完完全全的超大编制的军团。整个南洋新军无疑都是在战争中成长起来的队伍，所以，一直来，扩大队伍都是这些军官们的一致认识，在过去六年前，基于现有体制下，新军规模从最初的万余护**扩编到现在的十五万之众。
但是，十五万的军队意味着一个吓死人的基层编制数量……超过300个营！秦铠对于自己的军队有着深刻的认识。可以说，现在的南洋新军已经完全不同于旧编制的军队，以章奎的二镇来说，二镇的核心部队都是以参加越北战事成长出来的军队扩编的而来。
在辽阳的两年间，章奎派人前往各地招募劳力，同时在当地展开预备役的训练，北方战役一打响，他的队伍规模甚至超过了经营外东北多年的刘永福部，有近60个营的规模，滨海战役一打响。光是命令传达、军资补给，就发生了不小的麻烦。毕竟这些都是关乎战事最重要的问题，更别提重火力配置、军官伤亡补充等等突发事件了。
章奎最后也不得不采取抽调参谋部的人员进行协调的指挥模式，不过，也正是经过战争的检验，军官们对于立刻进行军制改革的重要xing十分认同，毕竟，军队战斗力唯一的判断标准就是是否能贯彻作战目标！
而且，更重要的是，军政部下达的新编制中，可以说是为军中提供了更多的军官位置，这无疑是对各镇参战的极大奖励，经历北方战争中成长起来的这一批优秀军人，战胜了北方恶劣自然环境和深入敌境作战考验，即便是那些老兵，都是军队中不可多得的优秀苗子。