想亲身观察体验由人类扣动扳机的神化觉醒，还有比作为觉醒核心的初号机与碇真嗣更靠近的观众席吗？
在和融入初号机的碇唯达成一致后，程斌就开始在她们母子身上动手脚。
因为要防备无处不在的莉莉丝灵魂碎片察觉到异常，程斌不能简单粗暴地顶替掉这些觉醒的核心部件，他在安顿好这对母子的灵魂后，用念气原样模拟出他们之前的状态。
在这个基础上，程斌遵循着模拟灵魂算法的运作，在合情合理的算法抉择中进行偏向性的选择，一点一点地将模拟出的灵魂化身改造成符合自己需求、可以任意操纵的模样。
反正使徒灵魂和程斌的念气一样都没有完全掌控底层物质，不可能真正穷尽算法所有变化，渚薰记忆里那么多轮回中各种各样的情况都有发生过，程斌动手促成的这些改变，幅度虽然积累起来会令人面目全非，但一点都不显得突兀异常。
如此，程斌轻松套着名为EVA初号机和碇真嗣的壳子上市，顺理成章地参合进了这个世界无限轮回的核心觉醒大戏中。
......
比起没有丝毫异常反应的使徒灵魂，第三新东京市立第一中学里，那些碇真嗣的同学老师们反倒对他的变化颇有感触。
这个特殊的中学，里面的学生基本都是第三新东京市这座要塞的相关工作人员后代，以及预备的EVA适格者。
碇真嗣由于小时候在NERV亲眼目睹自己母亲被EVA吞噬而被洗过脑，心中有着莫名的阴影残存，而在那之后他的父亲碇源堂又完全专注于NERV的工作，除了提供生活资源外完全无视了他这个儿子的存在。
这种情况下，孤身一人被放养长大的碇真嗣，性格极端内向，在社交中显得软弱而缺乏存在感。
不过这段时间碇真嗣似乎有了一些改变。
话多了一点点，表情丰富了一点点，更多地参与竞技锻炼与集体互动，似乎是因为同学朋友与某些心灵鸡汤文的刺激，开始主动努力改变自己整日自闭的处境。
这些渐进的改变并不是很显眼，大家都很自然地适应了真嗣的变化，顶多只是偶尔回忆起过去时开玩笑道“简直像变了个人一样”。
中学的老师对此乐见其成，还为真嗣的改变提供了不少的帮助。
但一直监控并保护着所有潜在驾驶员的某个机构内部有些杂音，因为人类补完计划心灵觉醒融合的宗教内涵，明显会参与其中的EVA初号机预定驾驶员有明显的心理缺陷对他们而言更符合需求。
不过这种事情毕竟没有确凿的理论依据，且碇真嗣的父亲碇源堂是NERV的总司令也是SEELE的得力干将，考虑到他的态度，也不能因为这种不靠谱的事情去随便干涉人家的儿子。
碇真嗣原来那种内向自闭心灵残缺的样子他们乐见其成懒得去改变，但人家因为灌了几口心灵鸡汤积极起来了...也没必要为此特意搞事情。
就在这种情况下，自觉生活越来越明亮阳光的碇真嗣，踏出了理所当然但偏离剧本的第一步。
第三新东京市地下的NERV总部，那座建设在空洞底部的巨大金字塔内，总司令独立办公室中。
“谁允许他过来的？”
维持着手肘撑桌双手交握挡住半边脸的姿势，司令桌前的碇源堂看着最新传递来的消息感到有些头疼。
“一个孩子想和自己不顾家的父亲好好交流一下有什么问题吗？听说他是在学校老师的建议与帮助下过来的。”
旁边的冬月笑了笑道：“当初你不是有给他留下一张NERV的出入卡吗？我记得权限还不低，看来这孩子是从杂物堆里翻出来了啊。”
碇源堂沉默了一阵后冷漠地说道：“...把他赶回去。”
“不用这么无情吧？”
冬月摇了摇头，比起状似冷漠的碇源堂，他倒是蛮喜欢这个碇唯的孩子的，算是爱屋及乌：“再说使徒来袭的时间已经临近，丽无法发挥出初号机的真正力量，如果出现万一，让一个毫无经验的驾驶员临时上阵驾驶初号机真的没问题？
“如果初战失利，就算我们最后活下来了，SEELE的支持力度恐怕也会大打折扣，而且其他组织与军队那边也不好交代啊，叫他们把希望寄托在一个未经训练的十四岁少年身上，也实在是太伤颜面了。”
“...如果让真嗣提前适应了，在驾驶EVA与使徒作战时他的精神刺激不够剧烈，无法引起碇唯的反应呢？”
有些迟疑的碇源堂顿了顿后低声道：“说到底，初号机里碇唯是否保留着意识，这十年我们一直都没有直接证实过。”
起码，初号机里的碇唯对他这个丈夫就毫无反应。
冬月叹了口气，如果初号机里的碇唯对自己孩子遭遇剧变时都没有丝毫反应，那他们的计划也就基本破产了。
十年前的EVA接入实验中，碇唯被EVA初号机吞噬后，碇源堂懊悔之余就开始寻找能再见到碇唯的办法。
最终他提出了人类补完计划，这个计划最终被寿命接近极限、依靠机械维生的SEELE组织成员批准执行，成为了使徒抵抗计划后不为人知的潜在部分。
但SEELE的人类补完计划，是令人类回归莉莉丝，心灵融合互补成为一个完整统一的超级生命体，而碇源堂的真实目的却并非如此，他希望自己和碇唯依旧能以独立的个体方式相见。
所以，让融合了碇唯的初号机觉醒，而他自己以亚当为钥与之融合，掌控神化觉醒最终的选择权，重新见到碇唯的同时阖家成神，实现碇唯最初的梦想——
日月星辰都将陨灭，而人类借由EVA达成永恒。
这注定了碇源堂会背叛SEELE，在最终的时刻争夺成神之钥。
在此之前，碇源堂和SEELE目标是一致的——消灭亚当与莉莉丝之外的所有使徒，否则两边的计划都没有实现的可能性，活跃状态的使徒会在人类补完的时候污染所有人类的灵魂篡夺成神之钥。
但是，当初碇唯的接入实验出现事故并不是意外...