“百年海军”这四个字道出了海军建设的艰难。廖泥鳅性急，他便找到李开鹏商量，能否从官军手中购得大海船，并招募有远航经验的水手。李开鹏便寻了机会宴请沿海制置司官员和水军将领，趁着他们酒意朦胧之时提出了这个想法，却被断然拒绝。大海船都是登记造册并定期检点，擅自变卖可是会掉脑袋的，有经验的水手更是水军的核心战力，那里会放手？不过他们听到李开鹏的开价之后，眼神又变得犹豫起来，口气也变得不再坚决，称此种事在大战之后再议。李开鹏当然知道他们的想法，大战之后必有战艘损毁，也会有人员伤亡。卖给流求公司的东西和流失的人员，便可以上报成为战损了。
对于海军建设，余柱的心情甚至比廖泥鳅还急迫。流求公司尽量做到低调，也注意保密工作，但数万人上岛动静实在不小，肯定会引起有心人的注意，进而会引起敌对势力的注意。“害人之心不可有，防人之心不可无”，余柱并不担心岛上的生番。那些部族人口稀少还相互敌对，不少部落甚至语言也不通。即便他们组织起来，就凭他们骨制和石制武器要打败流求公司简直是痴人说梦。那些武器如果没有涂抹毒药根本没有多大杀伤力，而毒药制取和保存不易，并不能大规模使用。
余柱担心的是外来势力，当下流求武装力量有三个营共一千五百人的海军，一个营五百人的陆军，另有一万左右的民兵。基隆港装备了火炮之后，根本不怕敌人进攻。即便敌人在港口附近抢滩登陆，陆军也有能力将其击退。但余柱和廖泥鳅知道，敌人根本不会攻打坚固的港口，而是获得制海权后利用船只的优势，四处进行袭扰，甚至会切断流求岛与外界的航线甚至封锁港口，使霹雳军不能从外界获得源源不断的人口、粮食和其它战略物资。没有强大的海军，便没有制海权，而如果失去了制海权，流求别说发展，即便生存也会是问题。
余柱的担心并非没有道理。当下基隆港周边五十里地都处于公司的有效管辖范围，也建了不少防御设施，却仍然是易攻难守。这片两三个县大小的区域内，原来有十九个食人生番部族，其中七个是夷它它部族的亲族。经过巫师巴莱的沟通，这七个部族均同意与雷神的使者和平共处，流求公司也承诺如果生番部落不攻击，便会给其相应的利益，包括教其种植庄稼，售卖粮食、盐、铁器等物资，还可以让部族儿童接受教育。
其余十二个部族根本无意与外来者和平，他们不但杀了夷它它及其亲族派去的使者，还不断袭击流求公司屯垦点的选址官员和探矿的技术人员，对此廖泥鳅毫不客气进行了报复。有了夷它它及其亲族部落的带路，流求步兵营轻松找到了袭击者在丛林中的寨子——准确说是一片杂乱低矮的窝棚群。在人员相差不大的情况下，训练有素又装备火器的军队对阵手拿石制武器的原始人，用脚趾头都能想到是什么结果。这些袭击者部落要么团灭，要么远远逃到更深的丛林之中去了。